El laboratorio de microbiología posee 4 cabinas de siembra separadas y dotadas del material necesario, área de preparación de medios. Cabina para determinación de microorganismos patógenos, equipo VIDAS, zona de lavado y esterilización de material. Cada una de las áreas constan con un sistema de climatización que mantiene 99% de pureza en el aire.

Determinación de Aerobios totales, Anaerobios mesófilos y termófilos, Basillus cereus, Clostridium botulínico, Coliformes totales, Coliformes fecales, Salmonella, Listeria, Esporas.

Determinación de pseudomona spp, pseudomona aeruginosa, recuento de mohos y levaduras, entre otros microorganismos.